Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
E330034G19RikQ3UWX6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms