Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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