Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
E130208F15RikQ3UPV3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms