Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem253Q3UNB8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem253Q3UNB8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms