Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mccc2Q3ULD5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mccc2Q3ULD5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms