Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CrxosQ3UL53 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CrxosQ3UL53 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms