Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E330014E10RikQ3UL33 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms