Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Smu1Q3UKJ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smu1Q3UKJ7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms