Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc61Q3UJV1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc61Q3UJV1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms