Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q3UJC8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3UJC8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms