Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf3b2Q3UJB0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf3b2Q3UJB0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms