Protein–RNA interactions for Protein: Q3UH93

Plxnd1, Plexin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnd1Q3UH93 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Plxnd1Q3UH93 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Plxnd1Q3UH93 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms