Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Gtpbp6Q3U6U5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gtpbp6Q3U6U5 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtpbp6Q3U6U5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms