Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf149Q3U2C5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf149Q3U2C5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms