Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pag1Q3U1F9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms