Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tatdn3Q3U1C6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tatdn3Q3U1C6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms