Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hace1Q3U0D9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms