Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc10Q3TLI0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc10Q3TLI0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms