Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms