Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trim71Q1PSW8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trim71Q1PSW8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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