Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd3Q14AI6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd3Q14AI6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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