Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Perm1Q149B8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms