Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rundc1Q0VDN7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Rundc1Q0VDN7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms