Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Cntnap5cQ0V8T7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cntnap5cQ0V8T7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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