Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Neurl1bQ0MW30 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Neurl1bQ0MW30 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms