Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ubxn2bQ0KL01 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn2bQ0KL01 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms