Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Kndc1Q0KK55 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Kndc1Q0KK55 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms