Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cass4Q08EC4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cass4Q08EC4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms