Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ssrp1Q08943 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ssrp1Q08943 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms