Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Calb2Q08331 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms