Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ebf1Q07802 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ebf1Q07802 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms