Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Col9a1Q05722 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms