Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cdk18Q04899 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cdk18Q04899 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms