Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Emx2Q04744 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Emx2Q04744 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms