Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff2Q03404 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff2Q03404 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms