Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epha4Q03137 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms