Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PrkczQ02956 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PrkczQ02956 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms