Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nucb1Q02819 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nucb1Q02819 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms