Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Htr1fQ02284 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Htr1fQ02284 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms