Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkcqQ02111 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkcqQ02111 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms