Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RykQ01887 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RykQ01887 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RykQ01887 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RykQ01887 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RykQ01887 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RykQ01887 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RykQ01887 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RykQ01887 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms