Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nme2Q01768 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms