Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sec23aQ01405 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sec23aQ01405 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms