Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EgfrQ01279 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EgfrQ01279 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms