Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rbp1Q00915 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp1Q00915 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms