Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VegfaQ00731 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VegfaQ00731 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms