Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GabpaQ00422 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GabpaQ00422 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms