Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stx2Q00262 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms