Protein–RNA interactions for Protein: P98063

Bmp1, Bone morphogenetic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp1P98063 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bmp1P98063 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bmp1P98063 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms