Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Brca2P97929 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Brca2P97929 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms